La gouvernance du Pôle est assurée par un conseil d’administration élu par les adhérents tous les quatre ans, et renouvelé par moitié tous les deux ans. Présidé par Hervé Moulinier, il se compose de 18 membres répartis en 4 collèges. Le Comité de Pilotage et de Coordination Interrégional (CPCI), instance commune au Pôle Mer Bretagne et au Pôle Mer PACA, complète l’organisation décisionnelle.

Le conseil d’administration élu en septembre 2008
Collège 1 : Grands groupes
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Groupe Roullier, Jean-Christophe Piot
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DCNS Brest, Christian Laurent*
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Thales Systèmes Aéroportés, Hervé Moulinier*
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Veolia, Alexandre Le Ster
Collège 2 : PME
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In Vivo Environnement, Didier Grosdemange
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iXSea, Patrick Griveau*
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Littoralis, Atilio François
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Science et Mer, Didier Le Tannou
Collège 3 : Universités et grandes écoles, centres de formation, centres de recherche et d’innovation technologique
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Ensieta, Francis Jouanjean
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Ifremer, Philippe Marchand*
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Station biologique de Roscoff, Bernard Kloareg
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Télécom Bretagne, André Chomette
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Université de Bretagne Occidentale, Pascal Olivard
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Université de Bretagne Sud, Eric Martin
Collège 4 : Organisations professionnelles, structures de développement économique dans le domaine de l’innovation
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CCI Brest, Michel Gourtay
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CRPMEMB, André Le Berre
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Technopôle Brest-Iroise, Michel Morvan
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Technopole Quimper-Cornouaille, Ronan Le Den
*Membres du bureau
Le CPCI
Le Comité de Pilotage et de Coordination Interrégional est le bras de liaison entre le Pôle Mer Bretagne et le Pôle Mer PACA. Composé des membres du bureau de chaque Pôle, il veille à la cohérence des projets labellisés par les deux Pôles, à leur non-redondance et à leur possible complémentarité.

L’Equipe d’Ingénierie et d’Animation
Composée de personnel mis à disposition par des membres du Pôle, l’Equipe d’Ingénierie et d’Animation (EIA) anime les cinq commissions thématiques du Pôle et gère les actions transversales que suppose son travail en réseau. Le fonctionnement original de cette équipe lui confère naturellement dynamisme et réactivité.
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Au sein de chaque commission, les membres de l’EIA détectent les compétences des entreprises et des laboratoires et favorise leur mise en relation,
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Ils incitent les divers acteurs du réseau à élaborer des projets collaboratifs innovants,
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Ils accompagnent les porteurs de projet à chaque étape : montage des partenariats et du projet, labellisation, recherche de financements et valorisation du projet,
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Ils gèrent les relations avec les PME, mènent des actions à l’international et entretiennent des contacts avec la Marine et l’action de l’Etat en mer,
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Ils prennent en charge les questions relatives à l’ingénierie financière, à l’intelligence et la veille économique, à la communication, ainsi qu’aux relations avec la presse.
Sa composition début 2010
Direction et permanents
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Hervé Moulinier, Président
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Patrick Poupon, Directeur
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Stéphane Alain Riou, Directeur adjoint
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Nisha Le Joliff, communication et relations avec la presse
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Gwenaelle Prigent, assistante
Thème 1 : Sécurité et sûreté maritime
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Jean-Yves Eouzan, Thales
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Benoît Zerr, Ensieta
Thème 2 : Naval et nautisme
Thème 3 : Ressources énergétiques marines
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Marc Boeuf, DCNS
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Nicolas Teisseire, Audélor
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Eric Vandenbroucke, Technopôle Brest-Iroise
Thème 4 : Ressources biologiques marines
Biotechnologies
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Rachel Portal-Sellin, Technopole Quimper-Cornouaille
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Raphaëlle Lebreton, Technopole Rennes Atalante
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Frédéric Le Sourd, Station Biologique de Roscoff
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Eric Deslandes, Université de Bretagne Occidentale
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Françoise Duprat, Technopôle Brest-Iroise
Pêche-Aquaculture
Thème 5 : Environnement et aménagement du littoral
Actions transverses
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Sébastien Cann, CCI Brest, relations avec les PME et relations internationales
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Françoise Duprat, Technopôle Brest-Iroise, ingénierie financière
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Dominique Kervazo, conseiller marine
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Marie-Marguerite Bourbigot, Veolia, relations internationales
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