IFREMER : avec près de 700 personnes et 45% des effectifs nationaux, le centre IFREMER de Brest est le plus important de l’Institut. Parmi les 12 départements du centre de Brest, 9 sont concernés par les thématiques de R&D du Pôle Mer :
- Biotechnologies marines,
- Dynamiques de l’environnement côtier,
- Océanographie physique et spatiale,
- Economie maritime,
- Géosciences marines,
- Sciences et technologies halieutiques (avec le centre IFREMER de Lorient),
- Technologie des systèmes instrumentaux,
- Essais et recherches technologiques,
- Navires et systèmes embarqués.
A Brest, le Centre IFREMER est un véritable campus qui accueille en outre une partie de la filiale GENAVIR (Groupement pour la Gestion des Navires) et des centres ou laboratoires relevant d'organismes nationaux : AFSSA, IPEV, INSU/CNRS, IRD. Au total, 1000 personnes travaillent sur le site.

Site Internet : www.ifremer.fr/brest

L’UBO : l’Université de Bretagne Occidentale est l’un des principaux partenaires du Pôle, notamment au travers de l’IUEM, mais aussi grâce à ses différents laboratoires animés par la volonté de contribuer au développement économique et de renforcer le transfert de technologie.
A l’UBO, plusieurs laboratoires sont partenaires de projets labellisés, c'est le cas du LEST, laboratoire d'électronique et systèmes de télécommunicationet du laboratoire immunologie et pathologie.
L’Université de Bretagne Occidentale s’est dotée d’un dispositif spécifique de transfert de technologie et de savoir-faire qui vise à valoriser les recherches menées dans les laboratoires universitaires en contribuant au développement du tissu économique régional. Bretagne-Valorisation associe aujourd’hui les 4 Universités bretonnes ainsi qu’un certain nombre de grandes écoles.

Site Internet : www.univ-brest.fr

L’IUEM : l’Institut Universitaire Européen de la Mer, créé en 1997 au sein de l’Université de Bretagne Ouest, compte 166 permanents dont 55% font partie de l’UBO, 35% du CNRS, 7% d’IFREMER, ainsi qu’une trentaine d’ingénieurs et chercheurs invités ou sous contrat et 350 étudiants. L’Institut assure des formations supérieures en océanographie physique, chimique, biologique, en géosciences, géographie, droit et économie de la mer. Les programmes de plusieurs Unités Mixtes de Recherche UBO-CNRS rejoignent les thèmes du Pôle : l’UMR « domaine océanique » travaille sur les géosciences, en recherche fondamentale et sur le développement d’outils, l’UMR « Géomer » étudie le fonctionnement de la zone côtière, un 3ème laboratoire étudie les cycles biochimiques ainsi que les écosystèmes côtiers. Sont aussi concernés le LEBHAM, laboratoire d’écophysiologie et biotechnologie des halophytes et des algues marines qui possède des collections d’algues de référence, le LCM, laboratoire de chimie marine, ainsi que le CEDEM, centre de droit et d’économie de la mer. L’IUEM développe de nombreuses coopérations à l’étranger, particulièrement avec les Etats-Unis, l’Allemagne et la Grande-Bretagne.

Site Internet : www.univ-brest.fr/IUEM

L’EPSHOM : l’Établissement Principal du Service Hydrographique de la marine est implanté à Brest. Outre le centre d’hydrographie et le centre militaire d’océanographie, il accueille aussi le centre de météorologie marine de Météo France. Avec un effectif total de 400 personnes, le SHOM assure des missions de service public liées à la sécurité de la navigation et des missions de soutien à la Défense. Il est un acteur de référence en océanographie opérationnelle fortement impliqué dans les réseaux internationaux d’observation des océans. Ses activités de recherche portent sur les technologies innovantes destinées aux levées hydrographiques, à la modélisation des phénomènes océanographiques, à l’information géographique, aux applications de télédétection à la cartographie marine …

Site Internet :  www.shom.fr

Le GESMA : le Groupe d’études sous-marines de l’Atlantique est le centre de la Délégation générale pour l’armement spécialisé dans les techniques de robotique navale, électromagnétisme des navires, de communication acoustique, de guerre des mines. Il fait porter son effort de recherche sur la robotique sous-marine pour des applications de lutte sous la mer.

Site Internet : www.defense.gouv.fr

L’IRD : l’Institut de Recherche pour le Développement, créé en 1944 sous le nom d’ORSTOM, compte 35 centres et représentations à travers le monde. Il conduit des programmes scientifiques centrés le développement des pays du Sud. Les activités du centre de Brest qui compte 40 personnes sont orientées vers les sciences de la mer. Implanté sur le campus IFREMER, le centre réalise, en lien avec ses partenaires des laboratoires voisins, des études concernant le climat tropical, l’océanographie du large et côtière, la modélisation, l’acoustique sous-marine, l’halieutique. Il gère aussi la flotte océanographique de l’Institut.

Site Internet : www.brest.ird.fr

L’IPEV : l’Institut Polaire Français Paul-Emile Victor, créé en 1992, met des moyens au service de laboratoires scientifiques nationaux de l’Université, du CNRS, du CEA, de l’INRA... A Brest, où il est basé, ce groupement d’intérêt public compte 50 personnes dont les 2/3 sont mis à disposition par le CNRS. L’IPEV définit les programmes scientifiques, organise les expéditions et gère les bases dans les régions polaires des deux hémisphères. Avec le « Marion Dufresne », il réalise des programmes d’océanographie .

Site Internet : www.ipev.fr

Le CNRS-INSU : l’Institut National des Sciences de l’Univers, créé en 1985 au sein du CNRS, développe et coordonne les recherches d'ampleur nationale et internationale en astronomie, en sciences de la terre, de l'océan et de l'espace. L’unité implantée à Brest est en charge de l’instrumentation océanographique.

Site Internet : www.dt.insu.cnrs.fr

L’AFSSA : l’Agence Française de Sécurité Sanitaire des aliments compte en Bretagne 2 de ses 10 laboratoires, à Ploufragan et à Brest. Le centre de Brest est spécialisé dans les pathologies des poissons. Ses recherches portent notamment sur les maladies parasitaires et infectieuses des poissons de mer et d’eau douce, la stimulation du potentiel immunitaire des poissons et l’expertise de médicaments en attente d’AMM.

Site Internet : www.afssa.fr

Le CEDRE : créé en 1978, à la suite du naufrage de l’Amoco Cadiz, le Centre de documentation, de recherche et d’expérimentations sur les pollutions accidentelles des eaux réalise des interventions de lutte contre les pollutions accidentelles par les hydrocarbures et les substances chimiques. Il assure la formation des personnels qui peuvent être confrontés à des cas de pollution dans les ports ou sur le littoral. Il mène un programme de recherche et développement sur les méthodes et les matériels antipollution.

Site Internet : www.le-cedre.fr

Le CETMEF : le centre technique maritime et fluvial qui dépend du ministère de l’Equipement compte, à Brest, 2 de ses 6 départements. Ils centrent leurs études, expertises, prestations d’ingénierie sur deux thématiques : «  environnement, littoral et voies d’eau », « systèmes et aides pour la navigation marine ». Ces deux départements mènent des projets communs avec le CEDRE et IFREMER notamment sur la surveillance littorale et les techniques de lutte contre la pollution.

Site Internet : www.cetmef.equipement.gouv.fr